O Corpo docente do PPG-Micro inclui, em sua maioria, Professores do IMPG, mas também conta com docentes de outras Unidades da UFRJ e de outras Instituições de Ensino superior, como FIOCRUZ, UFF e UERJ. O credenciamento é feito anualmente, por meio de editais e análise dos pleitos por uma comissão que inclui membros internos e externos ao Programa. Os critérios avaliados são: a capacidade de liderança, inserção nacional e internacional, produção científica acadêmica e tecnológica, contribuição para a diversificação das atividades do PPG-Micro, e financiamento de projetos.

Anualmente os docentes credenciados têm seu recredenciamento avaliado, considerando os mesmos parâmetros para o credenciamento dos novos docentes, além da contribuição pregressa com o PPG-Micro e a produção  de seus alunos.